El Programa Académico de Matemáticas, llamado inicialmente Carrera de Matemáticas, surgió en 1966, simultáneamente con la Facultad de Ciencias (Acuerdo No. 1 de 1966 del Consejo Directivo). A partir de su creación se han aprobado varias reformas; las tres últimas quedaron consignadas en las resoluciones 126 de 1989,125 de 1994 y 149 de 2002 del Consejo Académico.